Да, все комиссии биржи учтены при расчете целей и цен ордеров бота (в том числе и Grid-ботов). Из-за этого TakeProfit у сделок выставляется немного выше, чем указано в настройках бота.
Если на бирже доступна некоторая скидка на комиссию, как на Binance с BNB, вы получите немного большую прибыль, чем вы видите в статистике. Сам бот получит выгоду от комиссий BNB, чтобы совершать более быстрые и прибыльные сделки, но расчеты статистики выполняются без учета скидок на комиссию.